La Institución Educativa Rural Puerto Claver, tiene un convenio interinstitucional,  con el Servicio Nacional de Aprendizaje (SENA), para la articulación de la media Técnica, con estudiantes de grado 10° y 11°, los estudiantes de grado 10 cursan una técnica en Sistemas Agropecuarios Ecológicos y los de grado 11 una Técnica en Explotaciones Agropecuarias.

Con la Secretaria De Educación Departamental, se lleva a cabo el Programa Antioquia Digital, el cual Consiste en Formar clubes digitales con los estudiantes y la capacitación para los docentes en el manejo de la TIC.

Con la Fundación Nutresa está el programa Líderes Siglo XXI, para docentes y directivos docentes, que brinda una pauta para brindar una Educación de calidad a través de una planeación estratégica.

Con el Ministerio de Educación Nacional está el programa todos a prender, el cual está focalizado para los estudiantes de preescolar y Básica Primaria, el cual busca aplicar nuevas metodologías, la apropiación de estándares y competencias desde las áreas de Lenguaje y Matemáticas, fomentar el comportamiento lector en los estudiantes, todo esto mediante capacitación a los docentes de preescolar y Básica Primaria.